首先，报考的条件不一样。企业管理硕士只要符合国家统一的报考规定即可，也就是说，应届生与在职人员均可报考。报考MBA必须是大学本科毕业后有3年或3年以上工作经验的人员；大专毕业后有5年或5年以上工作经验的人员；已获硕士学位或博士学位并有2年或2年以上工作经验的人员(指毕业日到入学日)。

其次，联考科目不一样。MBA入学联考要参加全国试点62所院校的联考，联考科目是政治、数学、英语、管理、语文与逻辑。

第三，试题难度不同。一般来说，报考企业管理硕士参加的全国统一入学联考英语、数学的难度要高于MBA，但由于近年来国内MBA报考人数直在职升，竞争也相应越来越激烈。